Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmss1Q9CZT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmss1Q9CZT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms