Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3110001I22RikQ9CZ70 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
3110001I22RikQ9CZ70 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms