Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gins3Q9CY94 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins3Q9CY94 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms