Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ChtopQ9CY57 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms