Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm8Q9CXT6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm8Q9CXT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm8Q9CXT6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms