Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Exo5Q9CXP9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Exo5Q9CXP9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Exo5Q9CXP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Exo5Q9CXP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Exo5Q9CXP9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Exo5Q9CXP9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Exo5Q9CXP9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Exo5Q9CXP9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Exo5Q9CXP9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms