Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mgme1Q9CXC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms