Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smyd3Q9CWR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smyd3Q9CWR2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smyd3Q9CWR2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms