Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smurf1Q9CUN6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smurf1Q9CUN6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smurf1Q9CUN6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smurf1Q9CUN6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smurf1Q9CUN6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smurf1Q9CUN6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smurf1Q9CUN6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms