Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms