Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CRW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9CRW3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms