Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NmbQ9CR53 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbQ9CR53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms