Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PompQ9CQT5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms