Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mri1Q9CQT1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mri1Q9CQT1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms