Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp5f1Q9CQQ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms