Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rwdd1Q9CQK7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rwdd1Q9CQK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rwdd1Q9CQK7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms