Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CQC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms