Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CQ90 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms