Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp2Q9CQ73 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp2Q9CQ73 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms