Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpa3Q9CQ71 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpa3Q9CQ71 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms