Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd2Q9CQ48 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms