Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcab2Q9CQ46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Efcab2Q9CQ46 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcab2Q9CQ46 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms