Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS7

Pno1, RNA-binding protein PNO1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pno1Q9CPS7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pno1Q9CPS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pno1Q9CPS7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Pno1Q9CPS7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pno1Q9CPS7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pno1Q9CPS7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pno1Q9CPS7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms