Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe41Q99PV5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms