Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt23Q99PS0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt23Q99PS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms