Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12aQ99PQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim12aQ99PQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.2 ms