Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trim26Q99PN3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim26Q99PN3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim26Q99PN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms