Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2a1Q99PM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2a1Q99PM3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms