Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scd3Q99PL7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scd3Q99PL7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms