Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GpnmbQ99P91 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GpnmbQ99P91 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms