Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NsmfQ99NF2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NsmfQ99NF2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms