Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vgll1Q99NC0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll1Q99NC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms