Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sf3b1Q99NB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b1Q99NB9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.2 ms