Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcgf6Q99NA9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcgf6Q99NA9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms