Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6dQ99N07 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6dQ99N07 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms