Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd1Q99MV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd1Q99MV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms