Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CalcbQ99MP3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CalcbQ99MP3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CalcbQ99MP3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms