Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkd1Q99MH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkd1Q99MH6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkd1Q99MH6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms