Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Txnrd3Q99MD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Txnrd3Q99MD6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Txnrd3Q99MD6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms