Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm3Q99LJ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms