Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cstf3Q99LI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cstf3Q99LI7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms