Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp5lQ99LH9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp5lQ99LH9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bp5lQ99LH9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms