Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arrdc1Q99KN1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arrdc1Q99KN1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arrdc1Q99KN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms