Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Me2Q99KE1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Me2Q99KE1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Me2Q99KE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Me2Q99KE1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms