Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TrabdQ99JY4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TrabdQ99JY4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms