Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxf1Q99JX7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxf1Q99JX7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxf1Q99JX7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxf1Q99JX7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nxf1Q99JX7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nxf1Q99JX7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms