Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddb2Q99J79 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ddb2Q99J79 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Ddb2Q99J79 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Ddb2Q99J79 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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