Protein–RNA interactions for Protein: Q99J62

Rfc4, Replication factor C subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc4Q99J62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc4Q99J62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc4Q99J62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc4Q99J62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc4Q99J62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms