Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf112Q96DY5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf112Q96DY5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf112Q96DY5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms