Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc8b1Q925Q3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Slc8b1Q925Q3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Slc8b1Q925Q3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Slc8b1Q925Q3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Slc8b1Q925Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms